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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:55:21, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Raphanus sativus var. sativus RNA, contig: WG3_10173.
FX685264.1:77-95
ATATTTTTCTGAAGCATTGACCAAGCCAAA77GCTTATGCTGTCTTACGCCTCGGGCGTACGTCAACGACGAGAGGACAAG
BOGAJ62TR BOGA Brassica oleracea genomic clone BOGAJ62, genomic survey sequence.
BH250286.1:48-66
TAATTTTTGGAAGCATTGACCAAGCCAAAA48GCTTATGCTGTCTTACGCCTCGGGCGTACGTCAACGACGAGAGGACAAG
BoCig87O02/F BOCIG Brassica oleracea genomic, genomic survey sequence.
FI569205.1:3-21
AA3GCTTATGCTGTCTTACGCCTCGGTCGTACGTCAACGACGAGAGGACAAG
Brassica napus genome assembly, chromosome: C08.
HG994372.1:41360865-41360883
TAATTTTTGGAAGCATTGACCAAGCCAAAA41360865GCTTATGCTGTCTTACGCCTCGGGCGTACGTCAACGACGAGAGGACAAG
Brassica oleracea HDEM genome, scaffold: C8.
LR031879.1:50609202-50609220
TAATTTTTGGAAGCATTGACCAAGCCAAAA50609202GCTTATGCTGTCTTACGCCTCGGGCGTACGTCAACGACGAGAGGACAAG
Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 15.
CP123890.1:315653-315671
CTTGTCCTCTCGTCGTTGACGTACGCCCGA315653GGCGTAAGACAGCATAAGCTTTTGGCTTGGTCAATGCTTCCAAAAATTA
Aplidium turbinatum genome assembly, chromosome: 11.
OU964928.1:2368590-2368608
ACACCGCTGAAAAGCGTAATCCTATTCTTT2368590GGCGTAAGACAGCATAAGCAATAGGCATCCAATCAAAGGATGTGAACTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/gcttatgctgtcttacgcc
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : gcttatgctgtcttacgcc | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.211 | 0.202 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTTATGCTGTCTTACGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.319 | 0.108 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCGTAAGACAGCATAAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=45
0.320 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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