GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 16:28:35, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Populus trichocarpa clone Pop1-85E10, complete sequence.
AC182710.2:50980-51003
TATCCCTTTCAAACAAAATATTATATCCTA50980TCATGGAAAGGAACGGACGAATCCACTAGGTTTCATTGTTGCAGAGATGGGTTT
Populus nigra genome assembly, chromosome: 4.
OX637675.1:8555053-8555076
TATCCCTTTCAAACAAAATATTATATCCTA8555053TCATGGAAAGGAACGGACGAATCCACTAGGTTTCATTGTTGCAGAGATGGGTTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ggattcgtccgttcctttccatga
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ggattcgtccgttcctttccatga | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.329 | 0.320 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGATTCGTCCGTTCCTTTCCATGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.425 | 0.096 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCATGGAAAGGAACGGACGAATCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.427 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).