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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-11 23:48:17, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Paenibacillus guangzhouensis strain KCTC 33171 chromosome, complete genome.
CP045293.1:6050678-6050697
AAGCTCTCGTATTTGATCGATTACAATGTG6050678GTTCGGCTGTACTCTTTGAGTGAACAGGATTCTTCCTTGTCGCCAGCGAC
Roseivirga spongicola strain OXR-11 chromosome, complete genome.
CP139724.1:2894213-2894232
TTGATGAAATCAAGACCGAATAAATAGTTT2894213GTTCGGCTGTACTCTTTGAGTAGGAGTGTTGCCTTATAGCCAAATGAGCT
010914AVBC012083PG (AVBC) Royal Gala young shoot Malus domestica cDNA clone AVBC012083, mRNA sequence.
CN940980.1:331-350
AATCGGCTCCCCCGGCGCCAGCGGCTACGG331CTCAAAGAGTACAGCCGAACAAGTCACCGACGCCTCCTCCCGATCTCCGC
011001AVBC091087PG (AVBC) Royal Gala young shoot Malus domestica cDNA clone AVBC091087, mRNA sequence.
CN944140.1:331-350
AATCGGCTCCCCCGGCGCCAGCGGCTACGG331CTCAAAGAGTACAGCCGAACAAGTCACCGACGCCTCCCCCGATCTCCGCC
Malus domestica genome assembly, chromosome: 6.
OU744996.1:20407191-20407210
AATCGGCTCCCCCGGCGCCAGCGGCTACGG20407191CTCAAAGAGTACAGCCGAACAAGTCACCGACGCCTCCCCCGATCTCCGCC
Malus x robusta genome assembly, chromosome: 14.
OY720338.1:20277729-20277748
AATCGGCTCCCCCGGCGCCAGCGGCTACGG20277729CTCAAAGAGTACAGCCGAACAAGTCACCGACGCCTCCCCCGATCTCCGCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/gttcggctgtactctttgag
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : gttcggctgtactctttgag | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.370 | 0.361 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTTCGGCTGTACTCTTTGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.563 | 0.193 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCAAAGAGTACAGCCGAAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.566 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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