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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-12 12:42:34, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KS20034G05 KS20 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD096490.1:187-210
AAGTTCATCGATCGGGTGCTCAAGATTGGT187GGCATTGTTGTAACTCAACTCAACAATGATCCTTTGGCTGAGCTTAAAGCTCTA
TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig38895 mRNA sequence.
JW089139.1:1027-1050
AAGTTCATCGATCGGGTGCTCAAGATTGGT1027GGCATTGTTGTAACTCAACTCAACAATGATCCTTTGGCTGAGCTTAAAGCTCTA
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 8, sequence.
AP026703.1:161535337-161535360
AAGTTCATCGATCGGGTGCTCAAGATTGGT161535337GGCATTGTTGTAACTCAACTCAACAATGATCCTTTGGCTGAGCTTAAAGCTCTA
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 8.
CP124724.1:174277801-174277824
AAGTTCATCGATCGGGTGCTCAAGATTGGT174277801GGCATTGTTGTAACTCAACTCAACAATGATCCTTTGGCTGAGCTTAAAGCTCTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/gttgagttgagttacaacaatgcc
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : gttgagttgagttacaacaatgcc | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.169 | 0.160 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTTGAGTTGAGTTACAACAATGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.399 | 0.230 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCATTGTTGTAACTCAACTCAAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.402 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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