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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 15:52:03, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Ipomoea trifida cultivar NCNSP0306 chromosome 1.
CP025644.1:30212386-30212409
GGCCCCCACATATCATTGACTGATTGCAGG30212386TCCATATCTTTGCCTTAGCTCCCAAGAGAGAGAGAGAGAGATGTGAGAGATTTG
Ipomoea triloba cultivar NCNSP0323 chromosome 1.
CP025660.1:35895016-35895039
GGCCCCCACATATCATTGACTGATTGCAGG35895016TCCATATCTTTGCCTTAGCTCCCAAGAGAGAGAGAGAGATTTGCTTTTGTATGG
Ipomoea nil mRNA, clone: jm48h18, 3' end sequence, expressed in flower and flower bud, cultivar: Tokyo-kokei standard.
HY921513.1:151-174
AAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT151TGGGAGCTAAGGCAAAGATATGGACCTGCAATCAGTCAATGATGTGTGGGCCTG
Ipomoea nil DNA, BAC clone: JMHiBa-013G09, sequence: JMHiBa-013G09.b.
GA934145.1:541-564
AAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT541TGGGAGCTAAGGCAAAGATATGGACCTGCAATCAGTCAATGATGTGTGGGCCTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/tccatatctttgccttagctccca
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : tccatatctttgccttagctccca | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.180 | 0.171 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCCATATCTTTGCCTTAGCTCCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.403 | 0.224 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGGAGCTAAGGCAAAGATATGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.405 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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