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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 11:56:29, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

07-L026100.SEQ Pigeonpea genomic pGEM-T library Cajanus cajan genomic 3', genomic survey sequence.
CZ682013.1:86-105
TCAAACAAGAAAGTTTTAATGGTGCACAGT86TGAGAGGCAATGATGTTGGATGTAGACACACACACACACCTAAAACCATT
Potentilla sterilis genome assembly, chromosome: 7.
OY821760.1:49327020-49327039
TGCCCTAAATACCATCACGGCACAGCAGCT49327020TGAGAGGCAATGATGTTGGAGCTCGGCTGCTCTTCCGCCTCCGCTCCCTC
Macrobrachium nipponense isolate FS-2020 chromosome 3.
CP062023.1:72942798-72942817
ACTACTTACCAAAAACAGAGGCCAAAGTGA72942798TGAGAGGCAATGATGTTGGACAACCCCGCGAAGGAGTATCTGGAAAGACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/tgagaggcaatgatgttgga
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : tgagaggcaatgatgttgga | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.191 | 0.182 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAGAGGCAATGATGTTGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.286 | 0.095 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCCAACATCATTGCCTCTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.286 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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