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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:53:26, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Ipomoea nil cDNA clone:jm19m06, 5' end, single read.
BJ556283.1:206-229
TGAACGCAAATTTGCAGCCTTTAAGGTATG206GGTTTGAGAGGATTCTGTCCCTCAGAAGAAGTATTTGCGCTAAAGCTGTGATGT
Ipomoea nil cDNA clone:jmsf45g11, 5' end.
CJ754960.1:208-231
TGAACGCAAATTTGCAGCCTTTAAGGTATG208GGTTTGAGAGGATTCTGTCCCTCAGAAGAAGTATTTGCGCTAAAGCTGTGATGT
Ipomoea nil mRNA, clone: JMFN032I04, 5' end sequence, expressed in flower and flower bud, cultivar: Tokyo-kokei standard.
HY932875.1:186-209
TGAACGCAAATTTGCAGCCTTTAAGGTATG186GGTTTGAGAGGATTCTGTCCCTCAGAAGAAGTATTTGCGCTAAAGCTGTGATGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/tgagggacagaatcctctcaaacc
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : tgagggacagaatcctctcaaacc | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.150 | 0.141 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAGGGACAGAATCCTCTCAAACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.380 | 0.230 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTTTGAGAGGATTCTGTCCCTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.382 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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