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2025-04-03 13:05:30, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

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検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Hordeum vulgare subsp. vulgare cultivar Morex clone HVVMRXALLhA0668E22, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 10 unordered pieces.
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Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
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Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
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Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
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Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
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OX460240.1:4523966-4523989
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Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX460247.1:5202614-5202637
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Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX460254.1:4347158-4347181
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC4347158TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX460261.1:5384893-5384916
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC5384893TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX460268.1:5094060-5094083
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGGCCAC5094060TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX460275.1:6743657-6743680
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC6743657TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGCGGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX460282.1:2835886-2835909
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC2835886TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX460289.1:2731480-2731503
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC2731480TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX460296.1:5387529-5387552
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC5387529TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX460303.1:5761917-5761940
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC5761917TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX460310.1:5946268-5946291
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC5946268TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare subsp. spontaneum genome assembly, chromosome: 5H.
OX590738.1:5352794-5352817
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGGCCAC5352794TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare subsp. spontaneum genome assembly, chromosome: 5H.
OX590745.1:3433997-3434020
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC3433997TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare subsp. spontaneum genome assembly, chromosome: 5H.
OX590752.1:6366442-6366465
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGGCCAC6366442TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare f. agriocrithon genome assembly, chromosome: 5H.
OX590759.1:2995832-2995855
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC2995832TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare subsp. spontaneum genome assembly, chromosome: 5H.
OX590766.1:6295366-6295389
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGGCCAC6295366TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGCCGATTAATTAATTA
Triticum aestivum genome assembly, chromosome: 5B.
OX637238.1:6614692-6614715
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC6614692TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGCAGGCGTGACGCGTGCGATTAATTAGCACT
Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX638657.1:4951827-4951850
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC4951827TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare subsp. spontaneum genome assembly, chromosome: 5H.
OX638746.1:4415497-4415520
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC4415497TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGCCGATTTAATTAATT
Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX638753.1:5976265-5976288
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC5976265TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX638760.1:3442559-3442582
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC3442559TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare subsp. spontaneum genome assembly, chromosome: 5H.
OX638767.1:7043565-7043588
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC7043565TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare subsp. spontaneum genome assembly, chromosome: 5H.
OX638774.1:3509487-3509510
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGGCCAC3509487TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare subsp. spontaneum genome assembly, chromosome: 5H.
OX638781.1:5547543-5547566
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC5547543TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX638788.1:5866548-5866571
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC5866548TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare subsp. vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX638795.1:6149880-6149903
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC6149880TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare subsp. spontaneum genome assembly, chromosome: 5H.
OX638802.1:2988594-2988617
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGGCCAC2988594TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX638809.1:6237737-6237760
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC6237737TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare subsp. spontaneum genome assembly, chromosome: 5H.
OX638816.1:2801577-2801600
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC2801577TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare genome assembly, chromosome: 5H.
OX638823.1:4807178-4807201
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGGCCAC4807178TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare subsp. spontaneum genome assembly, chromosome: 5H.
OX638830.1:3009842-3009865
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC3009842TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare subsp. spontaneum genome assembly, chromosome: 5H.
OX638872.1:5752746-5752769
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC5752746TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGCCGATTAATTAATTA
Hordeum vulgare subsp. spontaneum genome assembly, chromosome: 5H.
OX638879.1:5267057-5267080
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC5267057TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCATGCCGATTAATTAATTA
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_1.
OY737381.1:3810207-3810230
TATCCGGTTAGCACCGATATTAAAGCCCAC3810207TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGATGATTAATTAATTA
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_2.
OY737388.1:3019616-3019639
TATCCGGTTAGCACCGATATTAAAGCCCAC3019616TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGATGATTAATTAATTA
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_1.
OY737396.1:4187452-4187475
TATCCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC4187452TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGACGATTAATTAATTA
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_2.
OY737403.1:4466138-4466161
TATCCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC4466138TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGACGATTAATTAATTA
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_1.
OY737413.1:4289506-4289529
TATCCGGTTGGCACGGATATTAAAGCCCAC4289506TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGATGATTAATTAATTA
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_2.
OY737420.1:4289506-4289529
TATCCGGTTGGCACGGATATTAAAGCCCAC4289506TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGATGATTAATTAATTA
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_2.
OY737438.1:6876715-6876738
TATCCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC6876715TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGATTAATTAATTAGCACCAC
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_3.
OY737478.1:2727161-2727184
TATCCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC2727161TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGGTGACGATTAATTAATT
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_1.
OY737493.1:1330773-1330796
TATCCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC1330773TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGGTGACGATTAATTAATT
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_3.
OY737507.1:10805756-10805779
TATCCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC10805756TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGACGATTAATTAATTA
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_4.
OY737514.1:2062256-2062279
TATCCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC2062256TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGCAGGCGTGACGCGTGACGATTAATTAATTA
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_1.
OY737522.1:4008146-4008169
TATCCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC4008146TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGATGATTAATTAATTA
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_1.
OY737615.1:3232406-3232429
GTTTCTGTTCGCACGGATATTAAAGCCCAC3232406TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGATGATTAATTAATTA
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_2.
OY737622.1:8106750-8106773
TATCCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC8106750TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGATGATTAATTAATTA
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_4.
OY737636.1:2411132-2411155
TATCCGGTTATCGCGGATATTAAAGCCCAC2411132TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGACGATTAATTAATTA
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_1.
OY737644.1:2874243-2874266
TATCCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC2874243TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGGTGACGATTAATTAATT
Hordeum bulbosum genome assembly, chromosome: 5H_2.
OY737877.1:2420178-2420201
TATTCGGTTAGCACGGATATTAAAGCCCAC2420178TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGACGATTGATTAATTA
Triticum timopheevii genome assembly, chromosome: 5At.
OY997269.1:5029826-5029849
TATTCGGTTAGCACCAATATTAAAGCCCAC5029826TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGTGTGCGATTAATTAGCACT
Triticum timopheevii genome assembly, chromosome: 5G.
OY997270.1:10907194-10907217
TATTCGGTTAGCACCGATATTAAAGCCCAC10907194TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGGTAGGCGTGACGCGTGCGATTAATTAGCACT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/tgtttagctaagctgttgctgagg
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : tgtttagctaagctgttgctgagg | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.221 | 0.212 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGTTTAGCTAAGCTGTTGCTGAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.418 | 0.197 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTCAGCAACAGCTTAGCTAAACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=0
0.418 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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