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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:54:25, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Ipomoea batatas Contig_38479.Ipbalsr mRNA sequence.
JP143067.1:222-245
ACAAGAAAAAGGTGGTTGTACGATGTGGAA222TTATTGGTCGGAGTGGGTATGGACGACATGTAGTAGTAGTAATAACAACAGGAT
Ipomoea triloba cultivar NCNSP0323 chromosome 7.
CP025666.1:13390982-13391005
ACAAGAAAAAGGTGGTTGTACGATGTGGAA13390982TTATTGGTCGGAGTGGGTATGGACGACATGTAGTAGTAGTAATAACAACAGGAT
Ipomoea nil cDNA clone:jmsf1a24, 3' end.
CJ759056.1:234-257
CTGTTATTACTACTACTACTACNTGTCGTA234GTCCATACCCACTCCGACCAATAATTCCACATCGTACAACCACCTTTTTGTTGT
Ipomoea nil cDNA clone:jmsf23l20, 3' end.
CJ760687.1:347-370
CTGTTATTACTACTACTACTACNTGTCGTA347GTCCATACCCACTCCGACCAATAATTCCACATCGTACAACCACCTTTTTGTTGT
TSA: Ipomoea batatas Contig_36624.Ipbalsr mRNA sequence.
JP141212.1:50-73
ATCCTGTTGTTATTACTACTACTACATGTC50GTCCATACCCACTCCGACCAATAATTCCACATCGTACAACCACCTTTTTCTTGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ttattggtcggagtgggtatggac
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ttattggtcggagtgggtatggac | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.182 | 0.173 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTATTGGTCGGAGTGGGTATGGAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.331 | 0.149 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTCCATACCCACTCCGACCAATAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.333 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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