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2026-01-05 04:58:21, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Malus domestica cultivar Red Fuji chromosome 10.
CP147802.1:18269269-18269288
TTAACTGAATTGTGATCAAGCTGAATAGCT18269269TTCCGAGAATCCTCTTCGACTTTTGTCCAATCACTGCATTACTCAAAACC
Malus domestica cultivar Red Fuji chromosome 10.
CP147811.1:17451030-17451049
TTAACTGAATTGTGATCAAGCTGAATAGCT17451030TTCCGAGAATCCTCTTCGACTTTTGTCCAATCACTGCATTACTCAAAACC
TSA: Pyrus x bretschneideri Unigene60055_XinShao mRNA sequence.
JR648328.1:86-105
TGCCATCGTAAGCGTAATGATTGGACAAAA86GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 10.
CP141919.1:26107035-26107054
GATTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA26107035GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 10.
CP141936.1:27103216-27103235
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA27103216GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 10.
CP141962.1:25068165-25068184
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA25068165GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 10.
CP141979.1:25552726-25552745
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA25552726GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 10.
CP143367.1:26874760-26874779
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA26874760GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 10.
CP143384.1:24652054-24652073
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA24652054GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus ioensis cultivar PI590015 chromosome 10.
CP154733.1:23538244-23538263
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA23538244GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus coronaria cultivar PI590014 chromosome 10.
CP154784.1:28475583-28475602
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA28475583GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Chaenomeles sinensis isolate sampleA chromosome 01.
CP162364.1:21998531-21998550
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA21998531GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus domestica cultivar WA 38 chromosome 10B.
CP165693.1:26747574-26747593
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA26747574GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus domestica cultivar WA 38 chromosome 10A.
CP165710.1:26145658-26145677
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA26145658GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus domestica cultivar Golden Delicious chromosome 10.
CP168774.1:26244938-26244957
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA26244938GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus domestica cultivar Golden Delicious chromosome 10.
CP168791.1:26426255-26426274
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA26426255GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus sylvestris genome assembly, chromosome: 10.
OU696512.1:26545221-26545240
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA26545221GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus domestica genome assembly, chromosome: 10.
OU696686.1:26659478-26659497
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA26659478GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus domestica genome assembly, chromosome: 10.
OU744551.1:26635723-26635742
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA26635723GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus domestica genome assembly, chromosome: 10.
OU744962.1:27502731-27502750
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA27502731GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus domestica genome assembly, chromosome: 10.
OU745000.1:26456655-26456674
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA26456655GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Malus x robusta genome assembly, chromosome: 4.
OY720328.1:25150660-25150679
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA25150660GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Crataegus laevigata genome assembly, chromosome: 4.
OY756941.1:25725288-25725307
GGTTTTGAGTAATGCAGCGATTGGACAAAA25725288GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA
Pyrus communis genome assembly, chromosome: 3.
OY757070.1:17903641-17903660
GGTTTTGAGTAATGCAGTGATTGGACAAAA17903641GTCGAAGAGGATTCTCGGAAAGCTATTCAGCTTGATCACAATTCAGTTAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ttccgagaatcctcttcgac
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ttccgagaatcctcttcgac | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.168 | 0.159 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=TTCCGAGAATCCTCTTCGAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.293 | 0.125 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=GTCGAAGAGGATTCTCGGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.309 | 0.015 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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