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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-04 04:00:26, GGGenome : DDBJ release 134.0, STS division (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

S217P60059FA7.T0 Noemie Pan troglodytes troglodytes STS genomic, sequence tagged site.
BV616112.1:618-632
GCAGTCTGGAGGTTCTCCCTGGAGGCTGTA618TTCATTGACAACATTGCCTGAGGTAACTCACACTGAGGTGACAAC
Homo sapiens DNA, STS on chromosome 7, D7S1548i, sequence tagged site.
AB132686.1:207-221
TCTACAGATTTTGGATTTACCAGCCCCCAC207AATGTTGTCAATGAATTCCTTAAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
S216P6277FB4.T0 Masuku Pan troglodytes troglodytes STS genomic, sequence tagged site.
BV633065.1:658-672
AATGCCCCACATTTCATTAAGGGTGATGAC658AATGTTGTCAATGAAGAAGTTGCTTCTCATATAACTATACTGTCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj134sts/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : ddbj134sts | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.082 | 0.073 | search_plus_done; http://172.18.8.136:50419/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.087 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.136:50419/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.089 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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