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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-22 12:47:24, GGGenome : Medium ground finch genome, GeoFor_1.0/geoFor1 (Apr, 2012)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

JH739892:3416562-3416576
AATTTATCTGCATAATCATGTGAATGTAAC3416562TTCATTGACAACATTACACATGGACAATTGATAATGAAATCATTG
JH739887:893863-893877
CCAGCTGTGACTCTGAAGGAGAGAAGGGGC893863AATGTTGTCAATGAAGGCACTTCTATTTTAATTTATAGGATAGCT
JH739888:17569337-17569351
AAATACCTTTGTGTGCTCATGTAGACATCA17569337AATGTTGTCAATGAAATAAAATTTCACAAAATTTACCTACATTTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/geoFor1/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : geoFor1 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.079 | 0.071 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28079/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.082 | 0.003 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28079/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.083 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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