GGGenome | Results

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2025-04-06 22:18:47, GGGenome : Crab-eating macaque genome, macFasRKS1912v2, D3G 24.03 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

chr2
position: 82749480-82749494

ACTATGCTGCACTCCAAATACTATTGTGTT82749480TTCATTGACAACATTCCCTATTACATATGCATATGAAAAACAGGC

chr5
position: 145071770-145071784

CAGAATATATTATCGCTTTGAACACAGATT145071770TTCATTGACAACATTTTGTGGGCATCCATTTAATATTAATATTAA

chr5
position: 161934065-161934079

TAAAACCTCTGATTTTGTGTAACACTCCTT161934065TTCATTGACAACATTAAACAGCAATTAACTATTTGCTGACTACAT

chr5
position: 177467467-177467481

TTTGGACCCCCAGATCAGTCTTCATATTCT177467467TTCATTGACAACATTCATGAAGTTCTGCAGAAATTAGATAGAATT

chr5
position: 182261015-182261029

GCCTGAGCCACCATGCCCAGCTTGCTATTC182261015TTCATTGACAACATTCACTTAAACAAACAAACATCCATAAAATTA

chr14
position: 84919887-84919901

TTGAGTTTCCAGGAACATAGATATGTCTTG84919887TTCATTGACAACATTCTAGCGTTGAGGACAGTGAATAGAGCAAAC

chr17
position: 47324578-47324592

TGTTCAAAGTTTTCCCCTCCAATGTATCTT47324578TTCATTGACAACATTCGGATTTATCACATCAATCAGTCAATAAAT

chr17
position: 64160464-64160478

GCAGTCTGGAGGTTCTCCCTGGAGGCTGTA64160464TTCATTGACAACATTGCCTGAGGTAACTCACACTGAGGTGACAAC

chr19
position: 38709181-38709195

GTGAGCCACCATGCTGGCCTATCTTAGCTT38709181TTCATTGACAACATTAGTATAATGTTAACAGCTCTCCTAAGGGAA

chr11
position: 75943955-75943969

GTAAGATAGGTTTGTTCCAGAAGTTTAAAA75943955AATGTTGTCAATGAATTTGATAAAATTTAATATTCACATTAGAAG

chr16
position: 63484173-63484187

TTCTGCCCTTTCACAAATAAACATAAAATC63484173AATGTTGTCAATGAAGCATGGCCCATCTAATATAGGCCCAGAGGC

chr19
position: 38499189-38499203

ACTCCCTTAGGAGAGCTGTAACATTATACT38499189AATGTTGTCAATGAAAAGCTAAGACAGGCCAGGGGTGGTGGCTCA

chr19
position: 38550077-38550091

CTCCCTTAGGAGAGCCGTTAACATTATACT38550077AATGTTGTCAATGAAAAAGCTAAGATAGGCAGGGCGTGGTGGCTC

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Debug Info:

0.009 | 0.009 | search_start;
0.083 | 0.074 | search_plus_done; http://172.18.8.77:28977/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.094 | 0.011 | search_minus_done; http://172.18.8.77:28977/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=41
0.096 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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