GGGenome | Results

2025-04-09 09:03:14, GGGenome : Mouse pre-spliced RNA, RefSeq curated protein coding on GRCm39/mm39, D3G 24.03 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

NM_018779.2|Pde3a;54611|chr6:141194994:141451666:+|prespliced::chr6:141194994-141451666(+)
position: 172260-172274

AAAGTACTATCAGTTTCCTAAATATATCCA172260TTCATTGACAACATTGTTCACTCTTCCATAAACATCTGCTGGTTA

NM_133235.3|Khdrbs2;170771|chr1:32211802:32697650:+|prespliced::chr1:32211802-32697650(+)
position: 212734-212748

TTTTTAAAGACAGCAGGAAATAGCAAATAA212734AATGTTGTCAATGAACAGTGTTTCCAAATGGTACATTAAGTATTC

NM_010586.2|Itpr2;16439|chr6:146009796:146403721:-|prespliced::chr6:146009796-146403721(-)
position: 327134-327148

ATCATGGTATCCACACAGAAGGCCCAGTTA327134AATGTTGTCAATGAAGTGATGACACAAACAGGGAGAATGTGTTCA

NM_019923.4|Itpr2;16439|chr6:146009796:146403721:-|prespliced::chr6:146009796-146403721(-)
position: 327134-327148

ATCATGGTATCCACACAGAAGGCCCAGTTA327134AATGTTGTCAATGAAGTGATGACACAAACAGGGAGAATGTGTTCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

タブ区切りテキスト → 表示 | ダウンロード
エクセル等の表計算ソフトに直接コピペできます。
CSV形式 → 表示 | ダウンロード
エクセル等の表計算ソフトにて開くことができます。
BED形式 → リンク | ダウンロード
GFF形式 → リンク | ダウンロード
JSON形式 → リンク | ダウンロード

Debug Info:

0.009 | 0.009 | search_start;
0.079 | 0.071 | search_plus_done; http://172.18.8.77:28980/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.084 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.77:28980/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.086 | 0.002 | cgi_end;