GGGenome | Results

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2025-04-10 21:05:10, GGGenome : Mouse genome, GRCm39/mm39, D3G 23.02 (Feb, 2023)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

chr1
position: 32424536-32424550

TTTTTAAAGACAGCAGGAAATAGCAAATAA32424536AATGTTGTCAATGAACAGTGTTTCCAAATGGTACATTAAGTATTC

chr2
position: 47223059-47223073

ATATCTATTTATTCATTGATGTAGCTTTCA47223059AATGTTGTCAATGAACACTGTTACTTCGTTGAGCACATGAAAAGT

chr3
position: 39374199-39374213

GTTGCCCCAGATTCAAGCTGCATGTTGACC39374199AATGTTGTCAATGAACTTCAACTACAAGTTCTGAGGCAGAATCTA

chr3
position: 42731951-42731965

TTAAACATCAGAGAAATGAAAAATAAGTAA42731951AATGTTGTCAATGAATAAACATCCCTGTAAGTTAAGGTTTGCAAT

chr5
position: 8430809-8430823

TAGCATCCATGCCCCCAAGCCAAAAGCATC8430809AATGTTGTCAATGAAACATTACTAAAGTTTAAAGTACATGTTGAC

chr2
position: 131322033-131322047

AGACAAATTAAGACTGTATTGTATCATGGT131322033TTCATTGACAACATTTAAAATTGTTACATATTTCAAAATTTTTTA

chr5
position: 42475572-42475586

TAGAATCAGTGTAAGCCATCCCTACACTTA42475572TTCATTGACAACATTCATGCAATCTTCAGTGTTCATTACTTTGCT

chr6
position: 141367254-141367268

AAAGTACTATCAGTTTCCTAAATATATCCA141367254TTCATTGACAACATTGTTCACTCTTCCATAAACATCTGCTGGTTA

chr6
position: 146076574-146076588

TGAACACATTCTCCCTGTTTGTGTCATCAC146076574TTCATTGACAACATTTAACTGGGCCTTCTGTGTGGATACCATGAT

chr10
position: 46938994-46939008

TATTTCTTTCTGTTTGTTTATATGATGGAC46938994TTCATTGACAACATTTCATATATGTAACCATCCTGTATCTCTGTA

chr14
position: 109479096-109479110

TGCTGCTGGAATCTCTCCCTGGAGGGTGTG109479096TTCATTGACAACATTGCCCACTGAGAGTGACAACCTCAGCAGCCA

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Debug Info:

0.009 | 0.009 | search_start;
0.082 | 0.073 | search_plus_done; http://172.18.8.78:28945/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.089 | 0.007 | search_minus_done; http://172.18.8.78:28945/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=45
0.093 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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