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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-11 05:50:10, GGGenome : Medaka genome, NIG/UT MEDAKA1/oryLat2 (Oct, 2005)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

chr4:5813899-5813913
AATGTGGCAGATCTGAAGGATGTTGTGGAG5813899TTCATTGACAACATTTCTTGGAGCATTAAAAACATATACCAGTAA
chr22:15483311-15483325
TGGCTCAAAACATTGACAGTTATCTGCAGA15483311TTCATTGACAACATTGGTTGTTTGAATTCAGTCTTTGTTTTTTTT
ultracontig90:1621423-1621437
TGTAACCCTAACCTGCAGGTCTTCAATGTG1621423TTCATTGACAACATTGATGAGAGGCTCCCCAGAATCGCTCTGTTC
chr2:28980457-28980471
TTTCTTTTGTGAGGGGCCTGCACCACAGAG28980457AATGTTGTCAATGAACTGGCTGAGGTTTTACACTATGTACTTTCT
chr6:24345667-24345681
AAATTAACTTCATCCGCAACAAAAAAGAAA24345667AATGTTGTCAATGAAAGCCACTTCCATTCTCGTAATACATAATTT
chr7:9428541-9428555
CATTGTGTTATGCGTCCTGATTGGCTGTAG9428541AATGTTGTCAATGAATCTCCTCCGTGCTGCATGTCCTGTACAGAC
chr20:10412061-10412075
AATTTGAATCACTTAAAAAAATGATAGCAA10412061AATGTTGTCAATGAAAAAAATTACAAACAAAAAAGATTCTGTCAA
scaffold3556:4762-4776
ACCAAGAAAACCGTCGATTGACAGCAAAGA4762AATGTTGTCAATGAATCCAAGGATGTTTCATCTTCATCAAAGGCG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:


GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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