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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-22 12:08:36, GGGenome : Rat pre-spliced RNA, RefSeq curated protein coding on rn6, D3G 21.01 (Jan, 2021)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

NM_053952.1|Nup155;117021|chr2:57206664:57258242:+|prespliced::chr2:57206664-57258242(+)
position: 27588-27602
CCTCTCCCATTTACATTTAGTTTTAAGTAA27588TTCATTGACAACATTTTTTGCATTGTTCAGCCCTTTACCTGTATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/rn6_RefSeqCuratedProtCoding_prespliced_d3g2101/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : rn6_RefSeqCuratedProtCoding_prespliced_d3g2101 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.081 | 0.073 | search_plus_done; http://172.18.8.75:28870/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.085 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.75:28870/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.085 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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