GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-21 22:52:16, GGGenome : Rat pre-spliced RNA, RefSeq curated on mRatBN7.2/rn7, D3G 22.02 (Feb, 2022)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

NM_053952.1|Nup155;117021|chr2:57201309:57252918:+|prespliced::chr2:57201309-57252918(+)
position: 27620-27634
CCTCTCCCATTTACATTTAGTTTTAAGTAA27620TTCATTGACAACATTTTTTGCATTGTTCAGCCCTTTACCTGTATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/rn7_RefSeqCurated_prespliced_d3g2202/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : rn7_RefSeqCurated_prespliced_d3g2202 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.088 | 0.079 | search_plus_done; http://172.18.8.78:28917/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.093 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.78:28917/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.093 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).