# [ GGGenome | 2024-11-24 02:16:38 ] # database: Crab-eating macaque pre-spliced RNA, TRaC 20.03 on macFasRKS1912, D3G 20.03 (Mar, 2020) # query: AATGTTGTCAATGAA # count: 9 # query: TTCATTGACAACATT # count: 29 # name strand start end snippet snippet_pos snippet_end query sbjct align edit match mis del ins ENSMFAG00000003495;TRaC2003L093ed|SYT1|chr11:75751393:76346690:+|prespliced + 245949 245963 TAAATGAATACAAAAGTACAAAATATATACCAACAAGGTATTTCCAATAATACATTAATGTATTGATGAGGTAAGATAGGTTTGTTCCAGAAGTTTAAAAAATGTTGTCAATGAATTTGATAAAATTTAATATTCACATTAGAAGTATTACCATTAAAACCAAAATATGACATACTTATTCTCTTCATTATTTTGGAATAGAAAAAATTATTCTT 245849 246063 AATGTTGTCAATGAA AATGTTGTCAATGAA ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 ENSMFAG00000003495;TRaC2003L093ee|SYT1|chr11:75752441:76106019:+|prespliced + 244901 244915 TAAATGAATACAAAAGTACAAAATATATACCAACAAGGTATTTCCAATAATACATTAATGTATTGATGAGGTAAGATAGGTTTGTTCCAGAAGTTTAAAAAATGTTGTCAATGAATTTGATAAAATTTAATATTCACATTAGAAGTATTACCATTAAAACCAAAATATGACATACTTATTCTCTTCATTATTTTGGAATAGAAAAAATTATTCTT 244801 245015 AATGTTGTCAATGAA AATGTTGTCAATGAA ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 ENSMFAG00000003495;TRaC2003L093f0|SYT1|chr11:75752441:76346693:+|prespliced + 244901 244915 TAAATGAATACAAAAGTACAAAATATATACCAACAAGGTATTTCCAATAATACATTAATGTATTGATGAGGTAAGATAGGTTTGTTCCAGAAGTTTAAAAAATGTTGTCAATGAATTTGATAAAATTTAATATTCACATTAGAAGTATTACCATTAAAACCAAAATATGACATACTTATTCTCTTCATTATTTTGGAATAGAAAAAATTATTCTT 244801 245015 AATGTTGTCAATGAA AATGTTGTCAATGAA ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 ENSMFAG00000003495;TRaC2003L093f1|SYT1|chr11:75752441:76346693:+|prespliced + 244901 244915 TAAATGAATACAAAAGTACAAAATATATACCAACAAGGTATTTCCAATAATACATTAATGTATTGATGAGGTAAGATAGGTTTGTTCCAGAAGTTTAAAAAATGTTGTCAATGAATTTGATAAAATTTAATATTCACATTAGAAGTATTACCATTAAAACCAAAATATGACATACTTATTCTCTTCATTATTTTGGAATAGAAAAAATTATTCTT 244801 245015 AATGTTGTCAATGAA AATGTTGTCAATGAA ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 ENSMFAG00000003495;TRaC2003L093f2|SYT1|chr11:75752441:76346776:+|prespliced + 244901 244915 TAAATGAATACAAAAGTACAAAATATATACCAACAAGGTATTTCCAATAATACATTAATGTATTGATGAGGTAAGATAGGTTTGTTCCAGAAGTTTAAAAAATGTTGTCAATGAATTTGATAAAATTTAATATTCACATTAGAAGTATTACCATTAAAACCAAAATATGACATACTTATTCTCTTCATTATTTTGGAATAGAAAAAATTATTCTT 244801 245015 AATGTTGTCAATGAA AATGTTGTCAATGAA ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 ENSMFAG00000003495;TRaC2003L093f3|SYT1|chr11:75752441:76346781:+|prespliced + 244901 244915 TAAATGAATACAAAAGTACAAAATATATACCAACAAGGTATTTCCAATAATACATTAATGTATTGATGAGGTAAGATAGGTTTGTTCCAGAAGTTTAAAAAATGTTGTCAATGAATTTGATAAAATTTAATATTCACATTAGAAGTATTACCATTAAAACCAAAATATGACATACTTATTCTCTTCATTATTTTGGAATAGAAAAAATTATTCTT 244801 245015 AATGTTGTCAATGAA AATGTTGTCAATGAA ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 ENSMFAG00000003495;TRaC2003L093f4|SYT1|chr11:75752441:76180993:+|prespliced + 244901 244915 TAAATGAATACAAAAGTACAAAATATATACCAACAAGGTATTTCCAATAATACATTAATGTATTGATGAGGTAAGATAGGTTTGTTCCAGAAGTTTAAAAAATGTTGTCAATGAATTTGATAAAATTTAATATTCACATTAGAAGTATTACCATTAAAACCAAAATATGACATACTTATTCTCTTCATTATTTTGGAATAGAAAAAATTATTCTT 244801 245015 AATGTTGTCAATGAA AATGTTGTCAATGAA ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 ENSMFAG00000003495;TRaC2003L093f5|SYT1|chr11:75752441:76105811:+|prespliced + 244901 244915 TAAATGAATACAAAAGTACAAAATATATACCAACAAGGTATTTCCAATAATACATTAATGTATTGATGAGGTAAGATAGGTTTGTTCCAGAAGTTTAAAAAATGTTGTCAATGAATTTGATAAAATTTAATATTCACATTAGAAGTATTACCATTAAAACCAAAATATGACATACTTATTCTCTTCATTATTTTGGAATAGAAAAAATTATTCTT 244801 245015 AATGTTGTCAATGAA AATGTTGTCAATGAA ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 na;TRaC2003L1a441|na|chr19:38556252:38627040:+|prespliced + 33447 33461 TGACTGCAGTGTGCTCCCTCTATGCCAGGTTCTTCGGTAAGTAAGTACTCTACATGACTTACTGCATTGCCTCCCTTAGGAGAGCCGTTAACATTATACTAATGTTGTCAATGAAAAAGCTAAGATAGGCAGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTTGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAG 33347 33561 AATGTTGTCAATGAA AATGTTGTCAATGAA ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 ENSMFAG00000042405;TRaC2003L15969|AC005838.1|chr16:63421341:63563178:-|prespliced - 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