GGGenome | Results

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2025-04-10 01:55:13, GGGenome : Mouse genome, GRCm38/mm10 (Jan, 2012)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

chr1
position: 32385455-32385469

TTTTTAAAGACAGCAGGAAATAGCAAATAA32385455AATGTTGTCAATGAACAGTGTTTCCAAATGGTACATTAAGTATTC

chr2
position: 47333047-47333061

ATATCTATTTATTCATTGATGTAGCTTTCA47333047AATGTTGTCAATGAACACTGTTACTTCGTTGAGCACATGAAAAGT

chr3
position: 39320050-39320064

GTTGCCCCAGATTCAAGCTGCATGTTGACC39320050AATGTTGTCAATGAACTTCAACTACAAGTTCTGAGGCAGAATCTA

chr3
position: 42777516-42777530

TTAAACATCAGAGAAATGAAAAATAAGTAA42777516AATGTTGTCAATGAATAAACATCCCTGTAAGTTAAGGTTTGCAAT

chr5
position: 8380809-8380823

TAGCATCCATGCCCCCAAGCCAAAAGCATC8380809AATGTTGTCAATGAAACATTACTAAAGTTTAAAGTACATGTTGAC

chr2
position: 131480113-131480127

AGACAAATTAAGACTGTATTGTATCATGGT131480113TTCATTGACAACATTTAAAATTGTTACATATTTCAAAATTTTTTA

chr5
position: 42318229-42318243

TAGAATCAGTGTAAGCCATCCCTACACTTA42318229TTCATTGACAACATTCATGCAATCTTCAGTGTTCATTACTTTGCT

chr6
position: 141421528-141421542

AAAGTACTATCAGTTTCCTAAATATATCCA141421528TTCATTGACAACATTGTTCACTCTTCCATAAACATCTGCTGGTTA

chr6
position: 146175076-146175090

TGAACACATTCTCCCTGTTTGTGTCATCAC146175076TTCATTGACAACATTTAACTGGGCCTTCTGTGTGGATACCATGAT

chr10
position: 47062898-47062912

TATTTCTTTCTGTTTGTTTATATGATGGAC47062898TTCATTGACAACATTTCATATATGTAACCATCCTGTATCTCTGTA

chr14
position: 109241664-109241678

TGCTGCTGGAATCTCTCCCTGGAGGGTGTG109241664TTCATTGACAACATTGCCCACTGAGAGTGACAACCTCAGCAGCCA

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Debug Info:

0.009 | 0.009 | search_start;
0.080 | 0.072 | search_plus_done; http://172.18.8.78:28019/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.088 | 0.008 | search_minus_done; http://172.18.8.78:28019/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=45
0.092 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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