GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-24 07:12:57, GGGenome : Oxytricha trifallax macronuclear genome

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Contig22561.0
position: 5419-5433
TTGCTTTTCTACCTCAATGATGTCCTCTAC5419TTCATTGACAACATTGTCAAATGTCCACTTGACAAATTTAGCAGC
Contig16902.0
position: 916-930
GCTGCTAAATTTGTCAAGTGGACATTTGAC916AATGTTGTCAATGAAGTAGAGGACATCATTGAGGTAGAAAAGCAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/oxy/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : oxy | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.079 | 0.071 | search_plus_done; http://172.18.8.72:28254/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.083 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.72:28254/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.084 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).