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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-22 06:02:26, GGGenome : Rhesus spliced RNA, RefSeq on Mmul_10/rheMac10, D3G 24.03 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

XR_001445025.2|LOC106998534;106998534|chr5:146514149:146527572:-|spliced::chr5:146514149-146527572(-)
position: 218-232
TTAATATTAATATTAAATGGATGCCCACAA218AATGTTGTCAATGAAAATCTGTGTTCAAAGCGATAATATATTCTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/rheMac10_RefSeq_spliced_d3g2403/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : rheMac10_RefSeq_spliced_d3g2403 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.079 | 0.070 | search_plus_done; http://172.18.8.77:28989/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.083 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.77:28989/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.084 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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