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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-06 02:59:44, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KS24058C10 KS24 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD123264.1:160-179
ATAGATAAATTTTATTCCTTCCTTAAAAAG160AAAGAGGGGTCGTTTTCGATAGACCATCCTCGACTCAAAACAGATGGAAA
TSA: Capsicum annuum MA_MegaContig_19975, mRNA sequence.
JW158740.1:175-194
ATAGATAAATTTTATTCCTTCCTTAAAAAG175AAAGAGGGGTCGTTTTCGATAGACCATCCTCGACTCAAAACAGATGGAAA
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 4.
CP124728.1:10168181-10168200
ATAGATAAATTTTATTCCTTCCTTAAAAAG10168181AAAGAGGGGTCGTTTTCGATAGACCATCCTCGACTCAAAACAGATGGAAA
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 4, sequence.
AP026699.1:243050932-243050951
TTTCCATCTGTTTTGAGTCGAGGATGGTCT243050932ATCGAAAACGACCCCTCTTTCTTTTTAAGGAAGGAATAAAATTTATCTAT
Hydrotaea cyrtoneurina genome assembly, chromosome: 1.
OY282512.1:48560247-48560266
CTGTTGTGCCAAGCCAAACTGCCAGTACTC48560247ATCGAAAACGACCCCTCTTTCACGATGTTGTCAAACACGAACATGTTGTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAAGAGGGGTCGTTTTCGAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAAGAGGGGTCGTTTTCGAT | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.427 | 0.419 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAAGAGGGGTCGTTTTCGAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.519 | 0.092 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATCGAAAACGACCCCTCTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.521 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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