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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 20:38:07, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CES07N09, 5' end sequence.
FY385060.1:169-188
CTCAACCGGTCACCATCCCCTCCTTCCCTG169AACAGTCCGCCCTACTCTCAGGCTGCCCGGTCAACCTGCCCGCCGCACTC
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CES09J16, 5' end sequence.
FY385732.1:171-190
CTCAACCGGTCACCATCCCCTCCTTCCCTG171AACAGTCCGCCCTACTCTCAGGCTGCCCGGTCAACCTGCCCGCCGCACTC
Dianthus caryophyllus mRNA, clone: CFES21N24, 5' end sequence.
FY402020.1:275-294
CTCAACCGGTCACCATCCCCTCCTTCCCTG275AACAGTCCGCCCTACTCTCAGGCTGCCCGGTCAACCTGCCCGCCGCACTC
TSA: Dianthus caryophyllus mRNA, contig: CAK09.613.C1.
FX297774.1:274-293
CTCAACCGGTCACCATCCCCTCCTTCCCTG274AACAGTCCGCCCTACTCTCAGGCTGCCCGGTCAACCTGCCCGCCGCACTC
Colias eurytheme genome assembly, chromosome: 21.
OU015413.1:486207-486226
CGGAAATTTATTTTTCATACCTGTAAGTGA486207TGAGAGTAGGGCGGACTGTTTTTCGGGACAGCTAGTGGACTATAATAATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AACAGTCCGCCCTACTCTCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AACAGTCCGCCCTACTCTCA | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.362 | 0.354 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AACAGTCCGCCCTACTCTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.461 | 0.099 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAGAGTAGGGCGGACTGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.462 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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