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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-02-25 15:59:28, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus genomic DNA, clone: LjB16I02, BM1852.
AP009634.1:71273-71292
TTATGATCCATCCAGTTGGTTAGAGACTCC71273AACATCACATTGCGTCATCGCCTGATGTCATTATAATTACTTGACCACTC
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 1, complete sequence.
AP022629.1:117990134-117990153
GAGTGGTCAAGTAATTATAATGACATCAGG117990134CGATGACGCAATGTGATGTTGGAGTCTCTAACCAACTGGATGGATCATAA
Anthocharis cardamines genome assembly, chromosome: 4.
FR989954.1:11585088-11585107
TTAACCTACTGTACACACAAGATAGATATG11585088CGATGACGCAATGTGATGTTTTAGAAAGTGACTAGTCTATCGTTTTCTTA
Ischnura senegalensis genome assembly, chromosome: 1.
OZ176221.1:122877211-122877230
TTTCACTCAAAACTTTTAAAAACATATTTA122877211CGATGACGCAATGTGATGTTGCTAGTTGATTTCAGCAACGAGGATAAGGT
Euchloe belemia genome assembly, chromosome: 5.
OZ203458.1:11926918-11926937
TAGACATACATTATATTGCTAAAAGATATG11926918CGATGACGCAATGTGATGTTTTAGAAAGTGACTCGTTTTCTTAAAACTTC
Anthocharis euphenoides genome assembly, chromosome: 4.
OZ219279.1:11987301-11987320
ATTTTTAACCTACTGTACACACAAGATATG11987301CGATGACGCAATGTGATGTTTTAGAAAGTTACTTGACTATCGTTTTCTTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AACATCACATTGCGTCATCG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AACATCACATTGCGTCATCG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.111 | 0.102 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=AACATCACATTGCGTCATCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.143 | 0.032 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CGATGACGCAATGTGATGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.146 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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