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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 19:27:18, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

01-L108077-1033-120-B01-ccfw IGS-SCF-1033 Bvu-KWS2320 fosmid genomic library Beta vulgaris subsp. vulgaris genomic clone IGS-SCF-1033-120-B01 5', genomic survey sequence.
JY353440.1:603-631
TGTATGGTCGCTATTCCCTACTAGACAAAC603AACTCTATCCAATCCTCACATGTTGTGCAAGTTGCAACCGCAAATATAATAAGCAAAAG
Beta vulgaris FLC-like 1 (FL1) gene, complete cds, alternatively spliced.
EF036526.1:29189-29217
TGTATGGTCGCTATTCCCTACTAGACAAAC29189AACTCTATCCAATCCTCACATGTTGTGCAAGTTGCAACCGCAAATATAATAAGCAAAAG
Beta vulgaris subsp. vulgaris genome assembly, chromosome: 6.
OX392552.1:64007221-64007249
TGTATGGTCGCTATTCCCTACTAGACAAAC64007221AACTCTATCCAATCCTCACATGTTGTGCAAGTTGCAACCGCAAATATAATAAGCAAAAG
Beta vulgaris subsp. vulgaris genome assembly, chromosome: 6.
OX392561.1:64994084-64994112
TGTATGGTCGCTATTCCCTACTAGACAAAC64994084AACTCTATCCAATCCTCACATGTTGTGCAAGTTGCAACCGCAAATATAATAAGCAAAAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AACTCTATCCAATCCTCACATGTTGTGCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AACTCTATCCAATCCTCACATGTTGTGCA | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.213 | 0.205 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AACTCTATCCAATCCTCACATGTTGTGCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.303 | 0.090 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGCACAACATGTGAGGATTGGATAGAGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.303 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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