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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:41:24, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Cannabis sativa PK04485.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP450128.1:424-443
TAATGGCAAATAGCTTATCTTCTCTTAAAC424AAGAGCTGGAACGAACAAAGCAAGAGCTTAGACAATTGAAATACCGGGAA
TSA: Humulus lupulus var. lupulus mRNA, contig: comp295787_c0_seq2.
LA658960.1:938-957
TAATGGCAAATAGCTTATCTTCTCTTAAAC938AAGAGCTGGAACGAACAAAGCAAGAGCTTCGACTATTGAAAGACCGGGAA
Humulus lupulus genome assembly, chromosome: X.
OY720650.1:203156879-203156898
TTCCCGGTCTTTCAATAGTCGAAGCTCTTG203156879CTTTGTTCGTTCCAGCTCTTGTTTAAGAGAAGATAAGCTATTTGCCATTA
Brachypalpus laphriformis genome assembly, chromosome: 1.
OX246753.1:172267390-172267409
ATGACGAGATAATTTAATATAAAGTACACT172267390CTTTGTTCGTTCCAGCTCTTGCTCTAGAAACTCATTAAATCTAGTTTTGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAGAGCTGGAACGAACAAAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAGAGCTGGAACGAACAAAG | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.191 | 0.182 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGAGCTGGAACGAACAAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.263 | 0.072 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTTGTTCGTTCCAGCTCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.264 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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