GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-04 12:01:10, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Cajanus cajan cultivar UPAS 120 contig23688.UPAS mRNA sequence.
EZ641405.1:707-726
ACCTTAGTTTGCTAGAGATTCAAAATGCTC707AAGGCCTAGCTGATGTATTGATGGAAATGCTTAGTGCCTTGAATCCGAAA
TSA: Cajanus cajan cultivar Asha contig31702.Asha mRNA sequence.
EZ679566.1:714-733
ACCTTAGTTTGCTAGAGATTCAAAATGCTC714AAGGCCTAGCTGATGTATTGATGGAAATGCTTAGTGCCTTGAATCCGAAA
TSA: Cajanus cajan cultivar Asha contig10382.Asha mRNA sequence.
EZ658246.1:327-346
TTTCGGATTCAAGGCACTAAGCATTTCCAT327CAATACATCAGCTAGGCCTTGAGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAGGCCTAGCTGATGTATTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAGGCCTAGCTGATGTATTG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.196 | 0.187 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGGCCTAGCTGATGTATTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.308 | 0.112 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAATACATCAGCTAGGCCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.309 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).