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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 18:08:30, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Populus tremuloides microsatellite PTR12.
AF240760.1:228-252
AGTAAGCGACACCAGAGGAAGCATTATAAC228AATAACCATCCCTCCAATAACCTACCATAAGAAATCAAAATCAGTACTTTTTATT
P_tremula-Br11-PTR12_r.ab1 P_tremula-Br11 Populus tremula genomic clone P_tremula-Br11-PTR12, genomic survey sequence.
JS807662.1:190-214
AATAAAAAGTACTGATTTTGATTTCTTATG190GTAGGTTATTGGAGGGATGGTTATTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AATAACCATCCCTCCAATAACCTAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATAACCATCCCTCCAATAACCTAC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.200 | 0.191 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AATAACCATCCCTCCAATAACCTAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.323 | 0.123 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTAGGTTATTGGAGGGATGGTTATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.324 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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