GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:06:07, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Astatotilapia calliptera genome assembly, chromosome: 12.
LS420030.2:34660905-34660924
AGCAGAGTCCCAAAAACCAACCAACCAAGA34660905AATAGACCGGTAAAACTTGCTCTCAGGTTCAAAGAGATGAATGCTAACCA
Brassica rapa genome, scaffold: A03.
LR031572.1:9173004-9173023
TTGCACATGACTTCTATTTTAATAGTATAG9173004AATAGACCGGTAAAACTTGCGAACCGATTATTTAGGGATGGTACTGTTCA
Brassica rapa genome assembly, chromosome: A03.
LS974619.2:9295476-9295495
TTGCACATGACTTCTATTTTAATAGTATAG9295476AATAGACCGGTAAAACTTGCGAACCGATTATTTAGGGATGGTACTGTTCA
Ligdia adustata genome assembly, chromosome: 2.
OX346215.1:15087358-15087377
AATATGCATGTCCCTTCCAAATATTACTAA15087358AATAGACCGGTAAAACTTGCACAGTTTATGGAAGAATTACGCAACCATTA
Neolamprologus multifasciatus genome assembly, chromosome: 12.
OY755025.1:3296767-3296786
TGGTTAGCATTCATCTCTTTGAACCTGAGA3296767GCAAGTTTTACCGGTCTATTTCTCGGTTGGTTGGTTTTTGGGACTCTGCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AATAGACCGGTAAAACTTGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATAGACCGGTAAAACTTGC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.350 | 0.341 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AATAGACCGGTAAAACTTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.447 | 0.097 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAAGTTTTACCGGTCTATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.448 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).