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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2026-03-08 00:55:59, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Crambus pratella genome assembly, chromosome: 22.
OZ254116.1:796681-796701
TGTTGCCCTATATTTTTGTGGCCATATATA796681ACAGCCACAGTTTGCTACATTTTGACATTTTGCCATAGCCCTTTATTGCTT
Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 2.
CP093344.1:47411815-47411835
TAAATCAAATTTCTGATGCTACCTGGCCAT47411815AATGTAGCAAACTGTGGCTGTATAGATTGTAACTGGAATTCCCAAATTTAA
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 2.
CP125302.1:45298669-45298689
TAAATCAAATTTCTGATGCTACCTGACCAT45298669AATGTAGCAAACTGTGGCTGTATAAATTATAACTGGAATTCCCAAATTTAA
Torilis japonica genome assembly, chromosome: 8.
OZ239990.1:49961892-49961912
TAAATCAAATTGTTGATGCTACCTGACCGT49961892AATGTAGCAAACTGTGGCTGTATAGATTGTAACTGGAATTCCCAAATTTAA
Torilis japonica genome assembly, chromosome: 8.
OZ240059.1:47200705-47200725
TAAATCAAATTGTTGATGCTACCTGACCGT47200705AATGTAGCAAACTGTGGCTGTATAGATTGTAACTGGAATTCCCAAATTTAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACAGCCACAGTTTGCTACATT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACAGCCACAGTTTGCTACATT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.219 | 0.210 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=ACAGCCACAGTTTGCTACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.374 | 0.155 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=AATGTAGCAAACTGTGGCTGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.377 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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