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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-05 17:20:29, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Brassica oleracea var. viridis mRNA, clone: KALE-001E19, 5' end sequence.
DK456062.1:121-140
TGAGTCTTCTTACAGATCTCGTTAACCTTA121ACCTCTCAGAGACAACTGACAAAATCATTGCGGAATACATATGGGTTGGA
h12_11na_1a.s 11na Brassica napus cDNA clone h12_11na_1a 5, mRNA sequence.
GT080702.1:82-101
TGAGTCTTCTTACAGATCTCGTTAACCTTA82ACCTCTCAGAGACAACTGACAAAATCATTGCGGAATACATATGGGTTGGA
Brassica napus mRNA for cytosolic glutamine synthetase isoform (BnGSR2-2).
Y12460.1:11-30
GTTAACCTTA11ACCTCTCAGAGACAACTGACAAAATCATTGCGGAATACATATGGGTTGGA
Crepidodera aurea genome assembly, chromosome: 2.
OX439473.1:16626669-16626688
AGCGCTATAGTTGAGGTCCCCAACCTGCCG16626669ACCTCTCAGAGACAACTGACGTTGTCCTTCGTTTTTTTTCTTTATTTATA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACCTCTCAGAGACAACTGAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACCTCTCAGAGACAACTGAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.456 | 0.447 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACCTCTCAGAGACAACTGAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.582 | 0.126 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTCAGTTGTCTCTGAGAGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.582 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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