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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-06 06:15:26, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Tachina grossa genome assembly, chromosome: 3.
OX465276.1:123569588-123569607
TCAAACTAAATTGCTTTCGATTTTACATGG123569588ACTTTCGGTTGGTGGTATGGTTAAAAAAATGTTACCACCTTAATGTATAT
Ophion ventricosus genome assembly, chromosome: 3.
OZ010713.1:1975766-1975785
TTTGTGCTCGCGCACTTGTGGTTGGTATTC1975766ACTTTCGGTTGGTGGTATGGTAACACTGGAACGTTTGTCATTGGCTTACA
Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 7.
CP093349.1:39265585-39265604
ATTACTTACACGAGAATGTTGATCTATGCT39265585CCATACCACCAACCGAAAGTATAATCTAATTTATTGATCCGAGAAGAACC
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 7.
CP125307.1:39347393-39347412
ATTACTTACACGAGAATGTTGATCTATGCT39347393CCATACCACCAACCGAAAGTATAATCTAATTTATTGATCCGAGAAGAACC
Cerceris rybyensis genome assembly, chromosome: 5.
OU342793.1:4285778-4285797
CTGTACAAACTCAACATGCCCGGTTTTTAT4285778CCATACCACCAACCGAAAGTACGCAACGTTCCATTCGGGGCGCAGGATAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACTTTCGGTTGGTGGTATGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACTTTCGGTTGGTGGTATGG | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.304 | 0.295 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACTTTCGGTTGGTGGTATGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.431 | 0.127 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCATACCACCAACCGAAAGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.433 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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