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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-06 04:09:55, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Musa acuminata subsp. malaccensis isolate AA chromosome 9.
CP126378.1:42523368-42523387
ACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTTTGTTC42523368ACCCTCACCTTCGGCTATCTTTTCTGCTGAGCGACATGTTCTTCGAATCC
Musa acuminata subsp. malaccensis isolate AA chromosome 20.
CP126389.1:42517324-42517343
ACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTTTGTTC42517324ACCCTCACCTTCGGCTATCTTTTCTGCTGAGCGACATGTTCTTCGAATCC
Musa acuminata subsp. malaccensis strain Doubled-haploid Pahang (DH-Pahang) genome assembly, chromosome: A09.
HG996474.1:42914464-42914483
TTCTCGGCCACTGCTGCTGCTGCTTTGTTC42914464ACCCTCACCTTCGGCTATCTTTTCTGCTGAGCAACATGTTCTTCGAATCC
Musa schizocarpa genome assembly, chromosome: S09.
LS990923.1:48314304-48314323
TCGGCCACTGCTGCTGCTGCTGCTTTGTTC48314304ACCCTCACCTTCGGCTATCTTTTCTGCTGAGCGACATGTTCTTGGAATCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGATAGCCGAAGGTGAGGGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGATAGCCGAAGGTGAGGGT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.184 | 0.175 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGATAGCCGAAGGTGAGGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.291 | 0.107 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACCCTCACCTTCGGCTATCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.294 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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