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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:48:35, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

AS1RN23P1F06.ab1 Healthy Roots (RN) Arachis stenosperma cDNA 5', mRNA sequence.
EH042510.1:172-191
TTTCTTGCTGGCGGGTCGGGACACAATCGC172AGCAGCGTTGACTGGATTTTTCATTCTGCTTTCGAAGAACCCGCATGTGG
Dur25.root.ADAA-aaf58a07.b1 DUR25-root Arachis duranensis cDNA 5', mRNA sequence.
GW935182.1:95-114
TTTCTTGCTGGCGGGTCGGGACACAATCGC95AGCAGCGTTGACTGGATTTTTCATTCTGCTTTCGAAGAACCCGCATGTGG
TSA: Arachis duranensis DurSNP_c4355.Ardu mRNA sequence.
HP004346.1:95-114
TTTCTTGCTGGCGGGTCGGGACACAATCGC95AGCAGCGTTGACTGGATTTTTCATTCTGCTTTCGAAGAACCCGCATGTGG
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A03.
CP030985.1:3721002-3721021
CCACATGCGGGTTCTTCGAAAGCAGAATGA3721002AAAATCCAGTCAACGCTGCTGCGATTGTGTCCCGACCCGCCAGCAAGAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGCAGCGTTGACTGGATTTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGCAGCGTTGACTGGATTTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.296 | 0.287 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGCAGCGTTGACTGGATTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.381 | 0.085 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAAATCCAGTCAACGCTGCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.381 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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