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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-01-10 02:12:17, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

PP_LEc0013N22f Peach shoot Prunus persica cDNA clone PP_LEc0013N22f, mRNA sequence.
DW347044.1:466-486
TAGGAAGAGATTGTATATACGATTCCTTTA466TTCCTATTTGTATCAATGGCTAACTTCACTAATTATCCAAAAAAGATGTAA
Prunus dulcis DNA, pseudomolecule Pd08.
AP019304.1:15042004-15042024
TAGGAAGAGACTGTATATACGATTCCTTTA15042004TTCCTATTTGTATCAATGGCTAACTTCACTAATTATCCAAAAAAGATGTAA
Antitrichia curtipendula genome assembly, chromosome: 8.
OX579640.1:20405218-20405238
CTCAATTGCAAGATTTTGAAGGAAAACTTC20405218TTCCTATTTGTATCAATGGCTATGGATTAATATTGTATCATAGTCTAGTTG
Anania crocealis genome assembly, chromosome: 12.
OX438861.1:7709224-7709244
ATTTTTGTATAAGCCTTAGTATAAGTATAG7709224TTCCTATTTGTATCAATGGCTGTATTAAACAAATAAAAAAAAAACTCACCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGCCATTGATACAAATAGGAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGCCATTGATACAAATAGGAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.344 | 0.335 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGCCATTGATACAAATAGGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.487 | 0.143 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTCCTATTTGTATCAATGGCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.490 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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