GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 14:38:00, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Ailanthus altissima genome assembly, chromosome: 20.
OX327702.1:11728644-11728664
TTTAGATATCACTAACTCTTATAACCTGAT11728644AGCTCTTGTAATATCCAATCCCTATTAGTAGTATTGGCGCTTAGATTTTAG
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 1, clone: LjT37G03, TM0675.
AP007507.2:90847-90867
CTTAGTGCCAGATAAGTTTAGAGTTTCTTA90847GGATTGGATATTACAAGAGCTGTATAAAAATCTTCTCACAATTAGACTCAT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 1, clone: LjB70O07, BM1196.
AP007888.2:154710-154730
CTTAGTGCCAGATAAGTTTAGAGTTTCTTA154710GGATTGGATATTACAAGAGCTGTATAAAAATCTTCTCACAATTAGACTCAT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 1, complete sequence.
AP022629.1:104003973-104003993
CTTAGTGCCAGATAAGTTTAGAGTTTCTTA104003973GGATTGGATATTACAAGAGCTGTATAAAAATCTTCTCACAATTAGACTCAT
Caenorhabditis sinica genome assembly, chromosome: I.
OZ009942.1:5905715-5905735
CATTCCCTTCCAAAGTGGATTGTTTTTGGA5905715GGATTGGATATTACAAGAGCTCATAACTAGATCAAATGTTTGCTTCCAACT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGCTCTTGTAATATCCAATCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGCTCTTGTAATATCCAATCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.358 | 0.350 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGCTCTTGTAATATCCAATCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.448 | 0.090 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGATTGGATATTACAAGAGCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.451 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).