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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:33:05, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Pipistrellus nathusii genome assembly, chromosome: 4.
OY882861.1:81676458-81676477
AGCTAAGGAGTTCCAAATTACTGGGAGGTC81676458AGCTTCCCATCCACATTCTGGCCAGTCTTATGGAATAAATCCTGAAGTTC
Pipistrellus nathusii genome assembly, chromosome: 4.
OY883181.1:81679725-81679744
AGCTAAGGAGTTCCAAATTACTGGGAGGTC81679725AGCTTCCCATCCACATTCTGGCCAGTCTTATGGAATAAATCCTGAAGTTC
Rhinatrema bivittatum genome assembly, chromosome: 8.
LR584394.1:97576176-97576195
ACAGGGTCTGTAACTTGCACCTCAGGGACT97576176AGCTTCCCATCCACATTCTGTTTATGCTCCTGGGCCCACTCAAAGAACTC
Melinaea menophilus n. ssp. AW-2005 genome assembly, chromosome: 10.
OU911047.1:6329337-6329356
ACATTATGAAAATTGGGCGAATCATTATTT6329337AGCTTCCCATCCACATTCTGGCATATTTTTTTAATTAGTATTATTATTGT
Porphyra yezoensis cDNA, clone:PFL020b02_r, 5'end.
AU191687.1:356-375
TTTGAGGTGCAGCCGATGAGCGTTAACCAC356CAGAATGTGGATGGGAAGCTCGCCACCTGCCCGGTCAATGGTACCGACAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGCTTCCCATCCACATTCTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGCTTCCCATCCACATTCTG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.157 | 0.148 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGCTTCCCATCCACATTCTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.214 | 0.057 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAGAATGTGGATGGGAAGCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.215 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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