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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-06 04:09:33, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

SlLH03c08g04f1 squirrel heart library 1 Callospermophilus lateralis cDNA clone 08g04 5', mRNA sequence.
CO734304.1:398-417
TCTTCAGGTGTTCCAGTGTCAGGGTCCTTG398AGGCTTGATGAACTGTTGCCCAGTGAAGGCTTCATACAGAGCAATATGAG
KS23001A04 KS23 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD111026.1:75-94
CTTCAGTACTGTGCATGTTAATCAATCATC75AGGCTTGATGAACTGTTGCCTTTCATATGCCAGTTTATCTATCTATCACT
KS24043G04 KS24 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD121888.1:62-81
CTTCAGTACTGTGCATGTTAATCAATCATC62AGGCTTGATGAACTGTTGCCTTTCATATGCCAGTTTATCTATCTATCACT
Capsicum rhomboideum cultivar Andean isolate CrT2T chromosome 6.
CP124714.1:171913072-171913091
TTTCAGTACTGTGCATGTTAATCAATCATC171913072AGGCTTGATGAACTGTTGCCTTTCATATGCCAGTTTATCACTTCATGTGT
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 12.
CP124720.1:262288048-262288067
CTTCAGTACTGTGCATGTTAATCAATCATC262288048AGGCTTGATGAACTGTTGCCTTTCATATGCCAGTTTATCTATCTATCACT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGGCTTGATGAACTGTTGCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGGCTTGATGAACTGTTGCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.583 | 0.574 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGGCTTGATGAACTGTTGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.683 | 0.101 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCAACAGTTCATCAAGCCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=45
0.683 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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