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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:13:21, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Thysanoteuthis rhombus genome assembly, chromosome: 11.
OY735208.1:34904986-34905007
ATGGGATAAGGAAAAAGTGATCAAATTCTG34904986AGGGGTGAAGGGATTTGTTTATATAAGATGTACTGCTGTGCGAAAACATCTA
RCLG379TP Castor bean cDNA library from leaves, 1.7 kb Ricinus communis cDNA clone RCLG379, mRNA sequence.
EG662775.1:535-556
ATATATATATATATATGATCTCTTGTAGAT535ATAAACAAATCCCTTCACCCCTACCCCCCTCCCCAACCAAAAGAATTAGATT
RCLGI55TP Castor bean cDNA library from leaves, 1.7 kb Ricinus communis cDNA clone RCLGI55, mRNA sequence.
EG664176.1:490-511
ATATATATATATATATGATCTCTTGTAGAT490ATAAACAAATCCCTTCACCCCTACCCCCCTCCCCAACCAAAAGAATTAGATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGGGGTGAAGGGATTTGTTTAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGGGGTGAAGGGATTTGTTTAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.168 | 0.159 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGGGGTGAAGGGATTTGTTTAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.373 | 0.205 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATAAACAAATCCCTTCACCCCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.374 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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