GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 16:21:52, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Micromys minutus genome assembly, chromosome: 2.
OZ004782.1:93490887-93490906
TTAGGTGTTCAAGGAAAGCATGGCATAGAA93490887AGGTGAGAGTCAAGGAATCCAGATCACCTACCACACCACAACCTTTCCAG
Meles meles genome assembly, chromosome: 15.
OV277456.1:16420607-16420626
TTAATGTACTTGGTTGGTTGAGCTGTCTTG16420607AGGTGAGAGTCAAGGAATCCTGGAGTGATAGTGTCTCTCTCGTGAGGGTG
Spisula subtruncata genome assembly, chromosome: 3.
OY787662.1:52024157-52024176
CTTCCTTTCGTTATTCCATTTTAGAGACAG52024157AGGTGAGAGTCAAGGAATCCGGGTGCGATACCCAAGCTCGTTTCGAATAG
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome X.
CP130739.1:150707784-150707803
GTGGAGGGAGTTTGCCATCAATGTTGATTC150707784GGATTCCTTGACTCTCACCTTTATTCCTTCAAACAATTCAATTGCGTTTG
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome Y.
CP130887.1:156209556-156209575
GTGGAGGGAGTTTGCCATCAATGTTGATTC156209556GGATTCCTTGACTCTCACCTTTATTCCTTCAAACAATTCAATTGCGTTTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGGTGAGAGTCAAGGAATCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGGTGAGAGTCAAGGAATCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.174 | 0.166 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGGTGAGAGTCAAGGAATCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.262 | 0.087 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGATTCCTTGACTCTCACCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.263 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).