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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:33:50, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

QM0AAC14AG03RM1 CCH3 Citrus clementina genomic clone CCH3019M05, genomic survey sequence.
ET107370.1:305-324
TTGATACAACTACTCTGACTGCAGCAACTA305ATAGCAATGGTGAAAGCGGTGAAAGCGCATCTGCAATTAAGGATAATATA
Felis catus Senzu DNA, chromosome: A1, American Shorthair breed.
AP023152.1:20371280-20371299
CTCCCTAAAATCAAGTACAAGACAAGAACG20371280ACCGCTTTCACCATTGCTATCATACATTACTGGAAACCCTGGCTAAAGTA
Citrus sinensis genome assembly, chromosome: 7.
OY754324.1:20425314-20425333
TATATTATCCTTAATTGCAGATGCGCTTTC20425314ACCGCTTTCACCATTGCTATTAGTTGCTGCAGTCAGAGTAGTTGTATCAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATAGCAATGGTGAAAGCGGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATAGCAATGGTGAAAGCGGT | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.151 | 0.142 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATAGCAATGGTGAAAGCGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.175 | 0.024 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACCGCTTTCACCATTGCTAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.176 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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