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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-06 03:59:39, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Bombyx mori Nichi01 DNA, chromosome 9, complete sequence.
AP026190.1:1372407-1372426
CGCGACTTATACTCTAGAGTCTAGACAATT1372407ATCAAACAATGCACCCATGAAACACATACAGGATGTAGGAAAACGCATCC
Bombyx mandarina Sakado DNA, chromosome 09, sequence.
AP028291.1:1377800-1377819
CGCGACTTATACTCTAGAGTCTAGACAATT1377800ATCAAACAATGCACCCATGAAACACATACAGGATGTAGGAAAACGCATCC
ICPM1G04 Microsatellite enriched genomic DNA library of pigeonpea Cajanus cajan genomic clone ICPM1G04 5', genomic survey sequence.
FI131393.1:240-259
GATTATGCTTGGCGTCGGCTTAGTTTGGTT240TCATGGGTGCATTGTTTGATTCGAGTATTTATTAGGGTTTTTGCATTCAT
Phragmites australis genome assembly, chromosome: 17.
OY282628.1:12618492-12618511
ATTGTTTAAGTGCATGATCAGGCTTTTGTG12618492TCATGGGTGCATTGTTTGATCCCTGCGTGGATCCCCTCTTCTGATCGTGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATCAAACAATGCACCCATGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATCAAACAATGCACCCATGA | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.331 | 0.323 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATCAAACAATGCACCCATGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.452 | 0.121 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCATGGGTGCATTGTTTGAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.454 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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