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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-04 12:12:17, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 8.
CP123883.1:218955-218974
TCATCAACTTGGCCAATCATCTTTACTCCT218955ATCGTTGATCTACCACCGGATAAATCTCTCATTCCCTGCAGAAAAAAAAA
Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 12.
CP123887.1:55941271-55941290
CTTTTTTTTCTGCAGGGAATGAGAGATTTA55941271TCCGGTGGTAGATCAACGATAGGAGTAAAGATGATTGGCCAAGTTGATGA
Brassica napus genome assembly, chromosome: A07.
HG994361.1:29171787-29171806
TTTTTTTTTCTGCAGGGAATGAGAGATTTA29171787TCCGGTGGTAGATCAACGATAGGAGTAAAGATGATTGGCCAAGTTGATGA
Brassica napus genome assembly, chromosome: C06.
HG994370.1:49896604-49896623
CTTTTTTTTCTGCAGGGAATGAGAGATTTA49896604TCCGGTGGTAGATCAACGATAGGAGTAAAGATGATTGGCCAAGTTGATGA
Brassica oleracea HDEM genome, scaffold: C6.
LR031880.1:46202856-46202875
CTTTTTTTTCTGCAGGGAATGAGAGATTTA46202856TCCGGTGGTAGATCAACGATAGGAGTAAAGATGATTGGCCAAGTTGATGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATCGTTGATCTACCACCGGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATCGTTGATCTACCACCGGA | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.262 | 0.254 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATCGTTGATCTACCACCGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.347 | 0.085 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCCGGTGGTAGATCAACGAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.349 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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