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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-04 11:30:07, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 12.
CP123887.1:55941073-55941092
GAATGAAGAGTTGGAAGGATTATAGAGGCT55941073ATGAACTCGGCACTCTGCATCAAAGAACAGCAAAGCAATATTGAGATTCA
Brassica napus genome assembly, chromosome: C06.
HG994370.1:49896406-49896425
GAATGAAGAGTTGGAAGGATTATAGAGGCT49896406ATGAACTCGGCACTCTGCATCAAAGAACAGCAAAGCAATATTGAGATTCA
Brassica oleracea HDEM genome, scaffold: C6.
LR031880.1:46202654-46202673
GAATGAAGAGTTGGAAGGATTATAGAGGCT46202654ATGAACTCGGCACTCTGCATCAAAGAACAGCAAAGCAATATTGAGATTCA
Lacanobia wlatinum genome assembly, chromosome: 28.
OX388050.1:3312368-3312387
AGAGCTCAGAGAGTGATGTAACTGGCCTGA3312368ATGAACTCGGCACTCTGCATCAGCGGATCAACTAGGTAACTAAATTTAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATGAACTCGGCACTCTGCAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATGAACTCGGCACTCTGCAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.178 | 0.170 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGAACTCGGCACTCTGCAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.280 | 0.101 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGCAGAGTGCCGAGTTCAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.280 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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