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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 16:13:31, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

pOP-CNH01617_EST_C_1_pSK_SK CNH (Oil Palm Non-Embryogenic Callus) Elaeis guineensis cDNA clone pOP-CNH01617 5', mRNA sequence.
EY402423.1:48-68
CGAACATGAAACCCAGCGTTAAGATCATCC48ATGCAAGGTTTTGTTGAAACTAATCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
Merzomyia westermanni genome assembly, chromosome: 1.
OX465288.1:58320415-58320435
TATCAGAGCAAATTAGTACTTTTCTCGCTC58320415ATGCAAGGTTTTGTTGAAACTTATAGAAAATAAGTACTTATTCCAATTTGC
Plagiodera versicolora genome assembly, chromosome: X.
OY757529.1:12759625-12759645
TTCTATAGTTTTATTCACTATAGCAGTCTG12759625AGTTTCAACAAAACCTTGCATTAGTTTATTATTGAATTTCACAAACTTTGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATGCAAGGTTTTGTTGAAACT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATGCAAGGTTTTGTTGAAACT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.226 | 0.217 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGCAAGGTTTTGTTGAAACT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.318 | 0.092 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGTTTCAACAAAACCTTGCAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.319 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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