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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:27:01, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Phragmites australis genome assembly, chromosome: 1.
OY282612.1:27748528-27748546
CAGTTCATGTGCAAGACTTGAGCCAAAGGC27748528ATGTTGATTACGAGACCTTTGTATCAAGTCAACAATGAGATGCATGATT
Citrus sinensis genome assembly, chromosome: 7.
OY754324.1:24255281-24255299
GTTAGCAGGCTAAGAATTGGTACCATGCAG24255281ATGTTGATTACGAGACCTTCAAGTTGCTTCAGGTTGCTCGTCTTTTTTG
Apotomis turbidana genome assembly, chromosome: 14.
LR990294.1:16359233-16359251
GGTTTAACTAGCTGAATACTGTTCAATTAG16359233ATGTTGATTACGAGACCTTAGAGGCTTAAATACCACTGAGAGTATTTTC
Citrus reticulata microsatellite DNA, locus mCrCIR06B05, allele 06B05-ga(26).
AM489744.1:421-439
CAAAAAAGACGAGCAACCTGAAGCAACTTG421AAGGTCTCGTAATCAACATCTGCATGGT
Avena sativa genome assembly, chromosome: 2.
OV702280.1:109145992-109146010
TCTCTACTAGAAACTATCCTATTATATCAG109145992AAGGTCTCGTAATCAACATGATTATTTTGTACTTTTTCAATCGGAAGGC
Stratiomys singularior genome assembly, chromosome: 1.
OX940877.1:163441375-163441393
GCGTAGCAATGTATCTATTTTGAGGGTGTG163441375AAGGTCTCGTAATCAACATTTCTTATTCCCAAGGTTTTCTCAGGATAAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATGTTGATTACGAGACCTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATGTTGATTACGAGACCTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.171 | 0.163 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGTTGATTACGAGACCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.249 | 0.077 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGGTCTCGTAATCAACAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.251 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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