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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-06 12:22:03, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Pyrus pyrifolia cultivar Housui mRNA, clone: TsuENH003_00379m, 5' end sequence.
AB450691.1:32-52
TCATTTTATTTTATTTTTCTTTTATTTCAG32CAAATTTCTCTGCCAGGCTCACGCGGGTGTTGATTCTCTCTCTCTCTCTCT
Pyrus communis genome assembly, chromosome: 16.
OY757083.1:336246-336266
TCATTTTATTTTATTTTTCTTTTATTTCAG336246CAAATTTCTCTGCCAGGCTCACGCGGGTGTTGATTCTCTCTCTCTCTCTCT
Ceriagrion tenellum genome assembly, chromosome: 1.
OY720632.1:167359406-167359426
CATTAAAGAGAAACAAGGTTAAGTTTCCTT167359406CAAATTTCTCTGCCAGGCTCATGTGCTTCACTGCCTTCAGAACCTTCTTGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAAATTTCTCTGCCAGGCTCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAAATTTCTCTGCCAGGCTCA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.380 | 0.371 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAAATTTCTCTGCCAGGCTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.500 | 0.120 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAGCCTGGCAGAGAAATTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.500 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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