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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:31:59, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Solanum melongena mRNA, clone: SEP08I24, 5'end, expressed in sepal at 10d after anthesis.
FS062901.1:399-418
TGATAATGGGACGGAAAAAGGGAATCTTGA399CACATTGGTGAAAGCCATTGCTGGGGTTTCTGTCGGTAGTCAAACTGACC
Fulvitalea axinellae DSM 100852 DNA, complete genome.
AP025314.1:1352649-1352668
GCTTAACACCATTATCTACGACCACGACAT1352649CACATTGGTGAAAGCCATTGTGGATAAGGCCAAAACGGCTGGAATTACGG
Solanum melongena mRNA, clone: LS001B17, 3'end, expressed in ovary at anthesis.
FS017757.1:97-116
GGTCAGTTTGACTACCGACAGAAACCCCAG97CAATGGCTTTCACCAATGTGTCAAGATTCCCTTTTTCCGTCCCATTATCA
Narthecium ossifragum genome assembly, chromosome: 9.
OY986971.1:2267384-2267403
CGGCCTTTGTATTCAGGTTTTGGTTGTAAG2267384CAATGGCTTTCACCAATGTGGGCATGTAGATGGATGAAACGTACAGATTT
Leptopterna dolabrata genome assembly, chromosome: 9.
OX940983.1:17766403-17766422
TGTTTCACACCACTGACCTACCAGAGCCAC17766403CAATGGCTTTCACCAATGTGGAAAGCTTGCACTTCCTAACATTCTACGAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CACATTGGTGAAAGCCATTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CACATTGGTGAAAGCCATTG | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.223 | 0.215 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACATTGGTGAAAGCCATTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.405 | 0.181 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAATGGCTTTCACCAATGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.407 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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