GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-03-15 17:56:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Trifolium repens mRNA, clone: WCC39k05_077, unspecified EST.
FY467967.1:21-40
CTACAATGTATCGCGTTCTT21CACCGCACCTTCTGTACCTTCGCAGAAGAATCAACCGCCGCCACCGCCGC
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 04_Occ.
CP125842.1:45809673-45809692
AAAAAGCACACTACAATGTATCGCGTTCTT45809673CACCGCACCTTCTGTACCTTCGCAGAAGAATCAACCGCCGCCACCGCCAC
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 04_Pall.
CP125843.1:42585782-42585801
AAAAAGCACACTACAATGTATCGCGTTCTT42585782CACCGCACCTTCTGTACCTTCGCAGAAGAATCAACCACCGCCGCCGCCAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CACCGCACCTTCTGTACCTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CACCGCACCTTCTGTACCTT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.189 | 0.180 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACCGCACCTTCTGTACCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.215 | 0.026 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGGTACAGAAGGTGCGGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.215 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).